29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  100 
 
 
170 aa  337  5.9999999999999996e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2398  Protein of unknown function DUF2505  46.71 
 
 
171 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2830  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257591  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2610  hypothetical protein  43.45 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1296  proteinase inhibitor I25 cystatin  32.93 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1241  hypothetical protein  32.14 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630151  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1883  hypothetical protein  30.49 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1222  hypothetical protein  33.74 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20520  Protein of unknown function (DUF2505)  35.34 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0605599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  29.61 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3798  hypothetical protein  32.17 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  29.61 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  29.61 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08750  Protein of unknown function (DUF2505)  27.81 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131074  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  31.88 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05540  hypothetical protein  28.47 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  30 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3383  hypothetical protein  26.42 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02610  Protein of unknown function (DUF2505)  28.44 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.344177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  30.97 
 
 
165 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1815  Protein of unknown function DUF2505  30.43 
 
 
394 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3647  Protein of unknown function DUF2505  31.09 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  25.83 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10489  hypothetical protein  25.98 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.224481  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2849  hypothetical protein  29.91 
 
 
173 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2866  hypothetical protein  29.91 
 
 
173 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2822  hypothetical protein  29.91 
 
 
173 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3116  hypothetical protein  22.6 
 
 
171 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.02824  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0780  Protein of unknown function DUF2505  24.39 
 
 
169 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>