27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0780 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0780  Protein of unknown function DUF2505  100 
 
 
169 aa  357  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576817  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3648  Protein of unknown function DUF2505  57.89 
 
 
172 aa  202  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0644  hypothetical protein  31.9 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0651  hypothetical protein  31.9 
 
 
167 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0664  hypothetical protein  31.9 
 
 
167 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0157573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02610  Protein of unknown function (DUF2505)  28.74 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.344177  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  31.21 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  31.21 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  31.21 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3647  Protein of unknown function DUF2505  31.61 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0779  Protein of unknown function DUF2505  28.82 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  25.44 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  30 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0091  hypothetical protein  27.68 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10489  hypothetical protein  28.16 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.224481  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2866  hypothetical protein  26.8 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2849  hypothetical protein  26.8 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2822  hypothetical protein  26.8 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3798  hypothetical protein  27.88 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2830  hypothetical protein  24.32 
 
 
168 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257591  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  20.37 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3116  hypothetical protein  26.59 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.02824  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1222  hypothetical protein  23.9 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3383  hypothetical protein  22.88 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  27.72 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  24.39 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1296  proteinase inhibitor I25 cystatin  20.24 
 
 
165 aa  40.8  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>