24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3648 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3648  Protein of unknown function DUF2505  100 
 
 
172 aa  360  7.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0780  Protein of unknown function DUF2505  57.89 
 
 
169 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576817  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0651  hypothetical protein  31.06 
 
 
167 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0664  hypothetical protein  31.06 
 
 
167 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0157573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0644  hypothetical protein  31.06 
 
 
167 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0091  hypothetical protein  26.55 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  24.28 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  24.24 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  28.74 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  27.17 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  28.74 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  26.01 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2849  hypothetical protein  24.42 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2822  hypothetical protein  24.42 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2866  hypothetical protein  24.42 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10489  hypothetical protein  25.43 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.224481  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3647  Protein of unknown function DUF2505  25.57 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0779  Protein of unknown function DUF2505  24.57 
 
 
166 aa  57.8  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02610  Protein of unknown function (DUF2505)  22.35 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.344177  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3383  hypothetical protein  23.12 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3116  hypothetical protein  25.56 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.02824  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1222  hypothetical protein  23.9 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3798  hypothetical protein  25.96 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  24.43 
 
 
170 aa  41.2  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>