More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1684 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1684  phosphate transporter  100 
 
 
387 aa  752    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00190537  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1143  phosphate transporter  81.5 
 
 
380 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.639626  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2455  phosphate transporter  75.54 
 
 
392 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000508699  normal  0.0283002 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1798  phosphate transporter  55.47 
 
 
434 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2057  phosphate transporter  56 
 
 
397 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.051228  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2217  phosphate transporter  53.39 
 
 
427 aa  368  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0911  phosphate transporter  58.02 
 
 
378 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10556  low affinity inorganic phosphate transporter integral membrane protein pitA  54.77 
 
 
417 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0205313  normal  0.167951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5449  phosphate transporter  53.68 
 
 
386 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0370554  normal  0.318098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1056  phosphate transporter  49.75 
 
 
407 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1527  phosphate transporter  52.62 
 
 
411 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331212  normal  0.0143461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0722  phosphate transporter  52.03 
 
 
416 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.163495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0728  phosphate transporter  52.03 
 
 
416 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.456434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0742  phosphate transporter  52.03 
 
 
416 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0939  phosphate transporter  50.89 
 
 
427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446978  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0188  phosphate transporter  50.25 
 
 
405 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449142  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0708  phosphate transporter  48.38 
 
 
417 aa  332  8e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0031  phosphate transporter  51.87 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  53.47 
 
 
370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  48.46 
 
 
334 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2027  phosphate transporter  49.37 
 
 
333 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  45.57 
 
 
332 aa  268  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  46.5 
 
 
332 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  45.43 
 
 
329 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  44.69 
 
 
333 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  47.96 
 
 
333 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  43.44 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  45.25 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  43.65 
 
 
333 aa  255  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  44.2 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0871  phosphate transporter  48.51 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  43.28 
 
 
332 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  46.1 
 
 
337 aa  252  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  43.08 
 
 
332 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  46.38 
 
 
336 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  43.69 
 
 
333 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0043  phosphate transporter  44.59 
 
 
331 aa  249  5e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  45.14 
 
 
336 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  47.15 
 
 
326 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  39.87 
 
 
332 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  44.34 
 
 
335 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  47.87 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  44.58 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  44.58 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  46.43 
 
 
337 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  42.63 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  42.63 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  41.46 
 
 
333 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  44.21 
 
 
336 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  44.94 
 
 
336 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  41.8 
 
 
335 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  42.68 
 
 
334 aa  242  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  44.95 
 
 
336 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  44.95 
 
 
336 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  43.65 
 
 
336 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  41.3 
 
 
333 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  43.34 
 
 
336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  43.34 
 
 
336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  43.97 
 
 
336 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0283  phosphate transporter  44.41 
 
 
334 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0849813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  44.63 
 
 
336 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  43.75 
 
 
336 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  43.75 
 
 
336 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0241  phosphate transporter  42.5 
 
 
334 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  43.83 
 
 
338 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  44.52 
 
 
336 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  44.52 
 
 
336 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  44.52 
 
 
336 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  42.9 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2817  phosphate transporter  45.6 
 
 
334 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  42.77 
 
 
332 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  42.43 
 
 
336 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33540  phosphate/sulfate permease  47.42 
 
 
334 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0469788  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  43.69 
 
 
354 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  43.69 
 
 
354 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  43.93 
 
 
336 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  42.12 
 
 
332 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  43.93 
 
 
336 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  43.93 
 
 
336 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  43.93 
 
 
336 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  43.93 
 
 
336 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  43.93 
 
 
336 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  45.14 
 
 
336 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2626  phosphate transporter  44.52 
 
 
327 aa  229  9e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  45.89 
 
 
334 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1152  phosphate transporter  42.22 
 
 
336 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0027  hypothetical protein  40.63 
 
 
331 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0028  hypothetical protein  40.63 
 
 
331 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  42.15 
 
 
332 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  41.74 
 
 
336 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2395  phosphate transporter  44.55 
 
 
336 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38618  normal  0.093565 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  40.92 
 
 
331 aa  225  9e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  46.03 
 
 
334 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  40 
 
 
332 aa  225  9e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  42.99 
 
 
336 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  40 
 
 
332 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2552  phosphate transporter  41.62 
 
 
354 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.729981  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1404  phosphate transporter  44.92 
 
 
336 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0317  phosphate transporter family protein  41.77 
 
 
336 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.178517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  41.96 
 
 
353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0749407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>