More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1470 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  100 
 
 		 336 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  88.1 
 
 		 336 aa  564  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  86.01 
 
 		 336 aa  567  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  86.01 
 
 		 336 aa  567  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  85.71 
 
 		 336 aa  552  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1152  phosphate transporter  83.93 
 
 		 336 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  81.85 
 
 		 336 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  78.87 
 
 		 336 aa  528  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5348  phosphate transporter  85.12 
 
 		 336 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  79.17 
 
 		 336 aa  514  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  75.89 
 
 		 336 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  75.3 
 
 		 335 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  76.49 
 
 		 336 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  75.89 
 
 		 336 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  75.89 
 
 		 336 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1404  phosphate transporter  78.27 
 
 		 336 aa  492  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  72.02 
 
 		 336 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  71.43 
 
 		 336 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  71.73 
 
 		 336 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  71.73 
 
 		 336 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  71.43 
 
 		 336 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  71.13 
 
 		 336 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  71.13 
 
 		 336 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  71.13 
 
 		 336 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0559  phosphate transporter  77.96 
 
 		 313 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2395  phosphate transporter  72.81 
 
 		 336 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38618  normal  0.093565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0917  phosphate transporter  73.11 
 
 		 336 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  71.13 
 
 		 354 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  71.13 
 
 		 354 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  71.13 
 
 		 336 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  71.13 
 
 		 336 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  71.13 
 
 		 336 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  71.13 
 
 		 336 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  71.13 
 
 		 336 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  71.13 
 
 		 336 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1792  phosphate transporter  73.83 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  67.6 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  62.39 
 
 		 336 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  61.66 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  60.12 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0749407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  62.46 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  62.15 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2946  phosphate transporter  61.64 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.747547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2523  phosphate transporter  62.46 
 
 		 338 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4384  phosphate transporter  58.31 
 
 		 352 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.622735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  63.09 
 
 		 334 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4361  phosphate transporter  58.01 
 
 		 352 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4228  phosphate transporter  58.31 
 
 		 352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  59.19 
 
 		 331 aa  356  3.9999999999999996e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3161  phosphate transporter  61.04 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5972  phosphate transporter  61.77 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5202  phosphate transporter  61.66 
 
 		 334 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5472  phosphate transporter  61.66 
 
 		 333 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0775  phosphate transporter  65.05 
 
 		 328 aa  342  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3605  phosphate transporter  60.82 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8018  phosphate transporter  60.18 
 
 		 335 aa  335  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1414  phosphate transporter  61.18 
 
 		 329 aa  332  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0843  phosphate transporter  53.96 
 
 		 332 aa  328  9e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3131  phosphate transporter  60.65 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0717  phosphate transporter  55.89 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0027  hypothetical protein  50.49 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0028  hypothetical protein  50.49 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0190  phosphate transporter  51.57 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  46.95 
 
 		 333 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  46.99 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  50 
 
 		 334 aa  291  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  47.09 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  46.79 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  47.88 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0180  phosphate transporter  50.61 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  48.16 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  49.54 
 
 		 336 aa  288  7e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  47.22 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  49.7 
 
 		 333 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  47.59 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0762  phosphate transporter  53.21 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  49.85 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  49.69 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  49.36 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  49.36 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  45.32 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  50.48 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  47.84 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  51.91 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  50.17 
 
 		 338 aa  271  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  49.68 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  47.35 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  45.03 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  47.73 
 
 		 334 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  46.58 
 
 		 332 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  46.89 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  45.99 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33540  phosphate/sulfate permease  51.42 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0469788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2027  phosphate transporter  48.61 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  44.38 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10556  low affinity inorganic phosphate transporter integral membrane protein pitA  43.73 
 
 		 417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0205313  normal  0.167951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  44.98 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  42.11 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  42.11 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2552  phosphate transporter  44.48 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.729981  normal  0.233057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>