More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0283 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0283  phosphate transporter  100 
 
 
334 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0849813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  94.91 
 
 
334 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0241  phosphate transporter  72.46 
 
 
334 aa  474  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  65.44 
 
 
334 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  64.24 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  64.04 
 
 
385 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  58.48 
 
 
336 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  62.62 
 
 
332 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  60.88 
 
 
337 aa  360  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2027  phosphate transporter  60.49 
 
 
333 aa  360  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0871  phosphate transporter  61.87 
 
 
330 aa  354  8.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  62.46 
 
 
332 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33540  phosphate/sulfate permease  61.13 
 
 
334 aa  347  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0469788  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2817  phosphate transporter  57.86 
 
 
334 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  50.47 
 
 
336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  55.26 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  49.7 
 
 
333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  51.06 
 
 
336 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  48.36 
 
 
333 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  49.1 
 
 
332 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  50.79 
 
 
332 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  47.92 
 
 
333 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  48.66 
 
 
333 aa  295  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  45.83 
 
 
333 aa  292  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  48.59 
 
 
333 aa  291  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  53.33 
 
 
334 aa  291  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  46.15 
 
 
332 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  51.26 
 
 
370 aa  289  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  47.42 
 
 
329 aa  285  9e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  50.15 
 
 
336 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2744  phosphate transport protein  49.2 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0588425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5449  phosphate transporter  48.48 
 
 
386 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0370554  normal  0.318098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  49.69 
 
 
336 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  50.31 
 
 
336 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  50.31 
 
 
336 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  50.16 
 
 
336 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  50.16 
 
 
336 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  49.85 
 
 
336 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  49.23 
 
 
335 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  48.77 
 
 
336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10556  low affinity inorganic phosphate transporter integral membrane protein pitA  46.85 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0205313  normal  0.167951 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  48.12 
 
 
338 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2552  phosphate transporter  47.8 
 
 
354 aa  271  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.729981  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  47.88 
 
 
336 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  45.35 
 
 
332 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  47.72 
 
 
336 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  49.38 
 
 
336 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  48.18 
 
 
332 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  48.18 
 
 
332 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0043  phosphate transporter  46.79 
 
 
331 aa  271  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  46.77 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  49.55 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  48.22 
 
 
336 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2499  phosphate transporter  50.15 
 
 
346 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.617445  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  48.66 
 
 
336 aa  269  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  49.23 
 
 
334 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  49.85 
 
 
336 aa  269  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  48.22 
 
 
336 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  47.63 
 
 
336 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  47.63 
 
 
336 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1152  phosphate transporter  50.15 
 
 
336 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2217  phosphate transporter  44.69 
 
 
427 aa  264  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  47.24 
 
 
336 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5472  phosphate transporter  50 
 
 
333 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0911  phosphate transporter  49.07 
 
 
378 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  47.87 
 
 
336 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  47.87 
 
 
336 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  47.87 
 
 
336 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  49.69 
 
 
334 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  46.83 
 
 
335 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1404  phosphate transporter  49.69 
 
 
336 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5202  phosphate transporter  48.41 
 
 
334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3131  phosphate transporter  47.95 
 
 
345 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2523  phosphate transporter  48.77 
 
 
338 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2395  phosphate transporter  48.65 
 
 
336 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38618  normal  0.093565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5348  phosphate transporter  47.83 
 
 
336 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2626  phosphate transporter  46.62 
 
 
327 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1748  phosphate transporter  47.59 
 
 
332 aa  257  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0493657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0717  phosphate transporter  44.41 
 
 
337 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  47.56 
 
 
336 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5972  phosphate transporter  49.24 
 
 
334 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1143  phosphate transporter  44.34 
 
 
380 aa  255  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.639626  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  47.83 
 
 
354 aa  255  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  47.83 
 
 
354 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  47.83 
 
 
336 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  46.08 
 
 
331 aa  255  9e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  47.83 
 
 
336 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  47.83 
 
 
336 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  47.83 
 
 
336 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  47.83 
 
 
336 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  47.83 
 
 
336 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1414  phosphate transporter  50.91 
 
 
329 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2946  phosphate transporter  46.95 
 
 
334 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.747547  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0939  phosphate transporter  43.6 
 
 
427 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446978  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0188  phosphate transporter  44.44 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449142  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  42.39 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1527  phosphate transporter  45.94 
 
 
411 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331212  normal  0.0143461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3161  phosphate transporter  49.09 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  46.39 
 
 
326 aa  252  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  43.84 
 
 
335 aa  252  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>