More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1805 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  97.92 
 
 
336 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  96.13 
 
 
336 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  95.83 
 
 
336 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  100 
 
 
336 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  100 
 
 
336 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  95.83 
 
 
336 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  95.83 
 
 
336 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  95.83 
 
 
336 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  92.56 
 
 
354 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  92.56 
 
 
336 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  92.56 
 
 
336 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  92.56 
 
 
336 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  92.56 
 
 
354 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  92.56 
 
 
336 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  92.56 
 
 
336 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  92.56 
 
 
336 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0917  phosphate transporter  91.02 
 
 
336 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2395  phosphate transporter  87.43 
 
 
336 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38618  normal  0.093565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1792  phosphate transporter  89.41 
 
 
336 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  79.46 
 
 
336 aa  525  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  80.36 
 
 
336 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  80.36 
 
 
336 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  77.38 
 
 
336 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  76.19 
 
 
335 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  73.51 
 
 
336 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  73.51 
 
 
336 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  71.43 
 
 
336 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  73.51 
 
 
336 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  73.93 
 
 
336 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  73.81 
 
 
336 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1152  phosphate transporter  73.51 
 
 
336 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  74.61 
 
 
336 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  69.35 
 
 
336 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5348  phosphate transporter  73.81 
 
 
336 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  67.26 
 
 
335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1404  phosphate transporter  70.54 
 
 
336 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0559  phosphate transporter  71.57 
 
 
313 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  61.77 
 
 
336 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  62.77 
 
 
334 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  61.66 
 
 
334 aa  368  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  62.78 
 
 
336 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  62.62 
 
 
334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2523  phosphate transporter  60.74 
 
 
338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5202  phosphate transporter  62.7 
 
 
334 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2946  phosphate transporter  60.12 
 
 
334 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.747547  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5972  phosphate transporter  62.65 
 
 
334 aa  352  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5472  phosphate transporter  62.06 
 
 
333 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3161  phosphate transporter  61.83 
 
 
336 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8018  phosphate transporter  62.7 
 
 
335 aa  345  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325586  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  57.98 
 
 
331 aa  344  1e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3605  phosphate transporter  61.44 
 
 
332 aa  342  5.999999999999999e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4384  phosphate transporter  55.14 
 
 
352 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.622735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4361  phosphate transporter  55.14 
 
 
352 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  54.87 
 
 
353 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0749407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4228  phosphate transporter  54.21 
 
 
352 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1414  phosphate transporter  60.06 
 
 
329 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0843  phosphate transporter  53.82 
 
 
332 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0775  phosphate transporter  62.42 
 
 
328 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123226 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0027  hypothetical protein  54.25 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0028  hypothetical protein  54.25 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0717  phosphate transporter  55.12 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3131  phosphate transporter  56.05 
 
 
345 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  51.49 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  50.16 
 
 
335 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  51.62 
 
 
332 aa  295  7e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  47.8 
 
 
333 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  48.91 
 
 
332 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  47.42 
 
 
333 aa  293  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  49.68 
 
 
337 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0190  phosphate transporter  50.16 
 
 
336 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177955 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  49.85 
 
 
336 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  51.83 
 
 
338 aa  292  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  47.04 
 
 
329 aa  291  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  46.58 
 
 
333 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  49.19 
 
 
336 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  50.44 
 
 
333 aa  288  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  45.79 
 
 
333 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  49.01 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  52.02 
 
 
332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0762  phosphate transporter  51.74 
 
 
343 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  48.44 
 
 
385 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  51.57 
 
 
334 aa  278  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0180  phosphate transporter  48.46 
 
 
334 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  45.89 
 
 
333 aa  277  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  46.65 
 
 
326 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  43.81 
 
 
332 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  48.34 
 
 
336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  48.29 
 
 
370 aa  271  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  47.12 
 
 
332 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0871  phosphate transporter  52.13 
 
 
330 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33540  phosphate/sulfate permease  51.08 
 
 
334 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0469788  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  46.91 
 
 
332 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1083  phosphate transporter  51.32 
 
 
336 aa  268  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  50.32 
 
 
337 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2499  phosphate transporter  48.61 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.617445  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  45.06 
 
 
332 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  44.76 
 
 
332 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  50.15 
 
 
334 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  46.37 
 
 
332 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  46.69 
 
 
332 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>