26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1207 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1207  type I restriction-modification system restriction subunit  100 
 
 
146 aa  303  4.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  67.11 
 
 
997 aa  207  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  66.91 
 
 
1031 aa  185  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  66.91 
 
 
1023 aa  184  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  69.06 
 
 
1002 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  54.55 
 
 
990 aa  157  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  54.35 
 
 
999 aa  157  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  47.22 
 
 
983 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  42.65 
 
 
969 aa  116  9e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  33.8 
 
 
991 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  32.35 
 
 
971 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  29.58 
 
 
1006 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  25.53 
 
 
965 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  20.74 
 
 
984 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  27.86 
 
 
1011 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  37.14 
 
 
1063 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  25.34 
 
 
1067 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0601  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0123243  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  28.06 
 
 
1034 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  27.86 
 
 
1023 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  26.35 
 
 
1060 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  27.86 
 
 
1022 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  41.07 
 
 
1069 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  34.29 
 
 
1052 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  29.27 
 
 
989 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  24.29 
 
 
1009 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>