30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0274 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  100 
 
 		 113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  48.31 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2116  signal recognition particle protein Srp19  40.91 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.1 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  41.18 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0432  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.37 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00986722  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  39.53 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.128282  hitchhiker  0.00176843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  45.95 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  42.7 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.93 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.88 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  39.19 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00643  signal recognition particle 19 kDa protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16820)  42.05 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60739  signal recognition particle subunit  38.46 
 
 		 276 aa  60.8  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.022276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1514  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  40.24 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.917345  normal  0.846669 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  36.56 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2309  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.52 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0613645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  35.37 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  41.54 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02240  signal recognition particle protein, putative  47.69 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2483  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  35.37 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1142  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333569  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0519  signal recognition particle, subunit SRP19  31.87 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0471  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.4 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44439  predicted protein  29.55 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0576  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  30.67 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00280682 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0367  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.98 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0173  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  38.64 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0541225  normal  0.197662 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0334  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.56 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.725093 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1746  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  35.09 
 
 		 96 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.100961  hitchhiker  0.00245079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>