29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1273 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2116  signal recognition particle protein Srp19  58.33 
 
 
104 aa  123  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  48.31 
 
 
113 aa  89  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  40.59 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1731  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  39.58 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.583276 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  39.53 
 
 
87 aa  72  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  40.23 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1746  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.54 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.100961  hitchhiker  0.00245079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  44.62 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0576  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  35.11 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00280682 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.4 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.64 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.2 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  44.62 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2309  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.82 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0613645  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0367  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  36.96 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.56 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.128282  hitchhiker  0.00176843 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  32.93 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1566  ribonucleoprotein complex SRP, SRP19 component  31.58 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44439  predicted protein  34.62 
 
 
210 aa  54.7  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00643  signal recognition particle 19 kDa protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16820)  38.89 
 
 
257 aa  53.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0432  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  28.05 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00986722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.5 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10601  predicted protein  32.32 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1514  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  29.27 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.917345  normal  0.846669 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02240  signal recognition particle protein, putative  40 
 
 
355 aa  48.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0471  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  27.91 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2483  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  28.89 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0519  signal recognition particle, subunit SRP19  27.55 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>