22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0367 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0367  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  100 
 
 
100 aa  207  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1566  ribonucleoprotein complex SRP, SRP19 component  45.36 
 
 
95 aa  90.5  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1746  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  41.24 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.100961  hitchhiker  0.00245079 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0576  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  40.82 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00280682 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1731  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  37.11 
 
 
97 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.583276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  36.96 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2116  signal recognition particle protein Srp19  34 
 
 
104 aa  60.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.44 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.11 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.18 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  33.33 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  42.86 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  36.71 
 
 
93 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00643  signal recognition particle 19 kDa protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16820)  40 
 
 
257 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  33.73 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.18 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  29.89 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02240  signal recognition particle protein, putative  41.67 
 
 
355 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  31.82 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.98 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2309  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  29.03 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0613645  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  27.59 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.128282  hitchhiker  0.00176843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>