22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0576 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0576  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  100 
 
 
95 aa  186  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00280682 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1566  ribonucleoprotein complex SRP, SRP19 component  74.74 
 
 
95 aa  142  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1746  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  69.47 
 
 
96 aa  142  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.100961  hitchhiker  0.00245079 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1731  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  64.21 
 
 
97 aa  124  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.583276 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  42.55 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0367  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  40.82 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  35.11 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2116  signal recognition particle protein Srp19  35.11 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.09 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.4 
 
 
87 aa  52  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2309  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.78 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0613645  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.94 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.88 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0432  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  30.77 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00986722  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  33.33 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  33.33 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  34.18 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  30.67 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.91 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0519  signal recognition particle, subunit SRP19  32.94 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.65 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.128282  hitchhiker  0.00176843 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  30.56 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>