17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0471 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0471  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  100 
 
 		 90 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2309  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  55.68 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0613645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0334  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  43.33 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.725093 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2483  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  50 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1514  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  47.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.917345  normal  0.846669 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.93 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.4 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  29.27 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  27.91 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  26.74 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  29.89 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1731  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  34.92 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.583276 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  30.38 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  29.11 
 
 		 93 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  28.74 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  30.23 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60739  signal recognition particle subunit  38.89 
 
 		 276 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.022276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>