52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0956 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
132 aa  274  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3727  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.63 
 
 
120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71299  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000718  hypothetical protein  49.59 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04357  glyoxalase family protein  50.82 
 
 
122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06603  lactoylglutathione lyase  50.41 
 
 
121 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0561  hypothetical protein  46.72 
 
 
122 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2084  hypothetical protein  43.33 
 
 
124 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1671  hypothetical protein  42.5 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1608  hypothetical protein  51.9 
 
 
80 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000377163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2123  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.04 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1450  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.14 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01187  Lactoylglutathione lyase 2396  31.9 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23670  hypothetical protein  35.78 
 
 
267 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0174073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2005  hypothetical protein  35.78 
 
 
267 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0293267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3503  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03509  bleomycin resistance protein  28.23 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1612  hypothetical protein  30.08 
 
 
235 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3720  bleomycin resistance protein  29.66 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1609  hypothetical protein  51.43 
 
 
37 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000295369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1008  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303728  normal  0.778304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0355287  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4171  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.51 
 
 
117 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6154  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
123 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137285  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2192  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.86 
 
 
125 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0194216  hitchhiker  0.00758205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4070  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.48 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1740  putative ring-cleaving dioxygenase  30.3 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0962  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 
382 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.547391  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.39 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.945266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1693  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.35 
 
 
194 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.984536  normal  0.249305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2924  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.78 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0660  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.62 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0631  hypothetical protein  28.07 
 
 
132 aa  40.8  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3357  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.62 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5010  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.62 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.7 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295231  normal  0.713495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20240  putative ring-cleaving dioxygenase  30.3 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.504368  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.85 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.238164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.48 
 
 
214 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2905  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.93 
 
 
129 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.62 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.3 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0946955 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6010  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.09 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.609831  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3843  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4543  hypothetical protein  26.72 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152385  normal  0.0948916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1871  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.4 
 
 
138 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.185318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>