28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000718 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000718  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  333  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06603  lactoylglutathione lyase  73.55 
 
 
121 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0561  hypothetical protein  58.68 
 
 
122 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.59 
 
 
132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3727  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55 
 
 
120 aa  131  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71299  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04357  glyoxalase family protein  48.36 
 
 
122 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1608  hypothetical protein  53.16 
 
 
80 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000377163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2084  hypothetical protein  37.5 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01187  Lactoylglutathione lyase 2396  35.65 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1671  hypothetical protein  36.67 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1450  hypothetical protein  32.43 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.9 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2123  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23670  hypothetical protein  34.19 
 
 
267 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0174073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2005  hypothetical protein  34.48 
 
 
267 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1609  hypothetical protein  47.22 
 
 
37 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000295369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1186  glyoxalase  25.81 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1285  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.53 
 
 
139 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  hitchhiker  0.00110448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5587  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
116 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10557  hypothetical protein  27.43 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.309454  normal  0.0411848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2671  hypothetical protein  26.02 
 
 
152 aa  41.2  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.06 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00159015  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3720  bleomycin resistance protein  27.43 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0725  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 
123 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308441 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0745  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 
123 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.047878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0731  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 
123 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2664  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000389195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3007  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
136 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.862449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>