50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3503 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3503  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
154 aa  313  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.87 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1008  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.96 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303728  normal  0.778304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0293267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.67 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3058  lactoylglutathione lyase  32.11 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0448  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000607107  hitchhiker  0.00303162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2150  putative bleomycin resistance protein  35.83 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.717419  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0046  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.48 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0272379  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4303  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.477386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169831  normal  0.239918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2005  hypothetical protein  31.62 
 
 
267 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3727  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71299  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1832  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.83 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5277  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
277 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23670  hypothetical protein  31.93 
 
 
267 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0174073 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2789  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0241  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.96 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0328  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 
143 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.96 
 
 
214 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0631  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  0.83803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3695  putative glyoxalase/Bleomycin resistance protein  29.75 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0561  hypothetical protein  27.34 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1698  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.37 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2412  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04357  glyoxalase family protein  32.43 
 
 
122 aa  44.3  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1035  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  43.9  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1079  hypothetical protein  38.78 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.81 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0355287  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0867  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00375378  normal  0.0656171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03509  bleomycin resistance protein  31.03 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4700  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1168  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2223  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32 
 
 
215 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0436044  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2738  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0889  hypothetical protein  38.78 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2126  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.45 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2019  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448415  normal  0.510288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2245  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 
131 aa  41.6  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1771  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2936  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.95 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3616  glyoxalase domain protein  28.81 
 
 
117 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000383151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0556  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.77 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1186  glyoxalase  23.33 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>