72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4700 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4700  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 130 aa  266  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4092  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.72 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.222076 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1186  glyoxalase  43.2 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1725  hypothetical protein  43.8 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.65 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2222  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.21 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.104746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2671  hypothetical protein  35.94 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2519  glyoxalase  35.11 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0683  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 		 577 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0400533  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.4 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0281  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.95 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.4 
 
 		 211 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1871  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2936  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4066  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.35 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.32661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1057  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.62 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0978  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00125904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4304  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.493161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6311  hypothetical protein  28.95 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2809  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1261  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.66307  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0037  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.79 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.43 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3046  glyoxalase family protein  26.77 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3047  glyoxalase family protein  26.77 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20380  lactoylglutathione lyase-like lyase  30.65 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.048723  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0820  hypothetical protein  34.31 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4569  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2231  glyoxalase family protein  26.77 
 
 		 127 aa  43.5  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.670656  hitchhiker  0.0000000139839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3010  glyoxalase family protein  26.77 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 		 201 aa  43.5  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5993  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.82 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1456  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.41 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0094  lactoylglutathione lyase protein  27.83 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3377  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134678  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0211  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.188471 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2874  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000288822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3503  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2799  glyoxalase family protein  25.98 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.192469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3883  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777877  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3011  glyoxalase family protein  25.98 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2750  lactoylglutathione lyase  25.98 
 
 		 127 aa  42  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000966791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3009  glyoxalase family protein  25.98 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16350  hypothetical protein  30 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2730  lactoylglutathione lyase  25.98 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.380625  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5403  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 		 135 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  31.06 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0080  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.21 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767302  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2051  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.622827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2714  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.89 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397884  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4171  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.83 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1457  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.59 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5320  hypothetical protein  25.2 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  33.05 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08920  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  26.67 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188096  normal  0.036935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0733  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375347  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3435  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.19 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.08 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0010  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.77 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3671  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.27 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2966  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3843  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0072  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.21 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0098  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.23 
 
 		 159 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0128551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4441  glyoxalase family protein  29.31 
 
 		 285 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.89 
 
 		 129 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1832  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.79 
 
 		 129 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10557  hypothetical protein  29.52 
 
 		 128 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.309454  normal  0.0411848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>