87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0072 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0072  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
117 aa  235  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0080  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  96.58 
 
 
117 aa  225  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767302  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.34 
 
 
119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0824  glyoxalase family protein  60.68 
 
 
117 aa  140  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0820  hypothetical protein  59.48 
 
 
116 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.297026 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0879  glyoxalase family protein  60.68 
 
 
117 aa  140  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4285  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.03 
 
 
137 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.76 
 
 
118 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0943124  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4966  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.97 
 
 
116 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.45 
 
 
116 aa  133  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4171  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.41 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3843  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.26 
 
 
117 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3547  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.31 
 
 
116 aa  131  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625968  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3466  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.63 
 
 
116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.018556 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3632  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.28 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.25 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.17 
 
 
117 aa  127  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3357  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.28 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5010  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.28 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.28 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0660  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.28 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.72 
 
 
116 aa  123  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4296  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.57 
 
 
115 aa  110  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5587  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.43 
 
 
116 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0094  lactoylglutathione lyase protein  44.44 
 
 
115 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08920  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  45.69 
 
 
115 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188096  normal  0.036935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5280  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.86 
 
 
117 aa  92  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3356  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.84 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3671  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.33 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0098  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.19 
 
 
159 aa  67  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0128551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3695  putative glyoxalase/Bleomycin resistance protein  33.06 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2376  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2059  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.79 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.538567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0037  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2936  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.28 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.31 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.78 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0867  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00375378  normal  0.0656171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.68 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0637718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2714  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.08 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397884  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6483  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.01 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4102  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.08 
 
 
274 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.64 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  32.22 
 
 
288 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2493  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.71 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000450738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.51 
 
 
258 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1749  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.67 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10904  hypothetical protein  30.25 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0009  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147506 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1768  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.01 
 
 
151 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.610611  normal  0.194183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0982  hypothetical protein  40.82 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.9 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1019  glyoxalase family protein  29.36 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.5 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5993  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.36 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337391  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.25 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.238164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3007  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.862449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1273  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.174094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4066  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
136 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.32661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1725  hypothetical protein  26.02 
 
 
156 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2271  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4900  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.032178  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.25 
 
 
136 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3444  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.38 
 
 
159 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3277  putative glyxalase protein  37.29 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.35593  normal  0.397302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6337  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.62 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2692  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.42 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0659876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1457  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.37 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2492  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.08 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1686  hypothetical protein  39.22 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1323  hypothetical protein  25.78 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1220  glyoxalase family protein  38.46 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.57 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0543  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.65 
 
 
259 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.494314  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2176  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.01 
 
 
171 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55662  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4186  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.67 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.67 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.85303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7340  hypothetical protein  32.14 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290015  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2320  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.08 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0566516  hitchhiker  0.00174079 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4700  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.21 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3041  putative lyase  29.17 
 
 
138 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467192  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1370  hypothetical protein  25 
 
 
121 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>