33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2744 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2744  fibrillarin  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0517  fibrillarin  67.66 
 
 		 199 aa  275  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0542  fibrillarin  65.67 
 
 		 200 aa  266  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1636  fibrillarin  63.68 
 
 		 200 aa  257  9e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0804  fibrillarin  48.72 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2264  fibrillarin  46.19 
 
 		 205 aa  164  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0802859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0661  fibrillarin  46.56 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0465318  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0406  fibrillarin  47.26 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0816972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1723  fibrillarin  43.19 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1916  fibrillarin  42.27 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1561  fibrillarin  44.15 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0628275  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2238  fibrillarin  46.11 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.665661 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0150  fibrillarin  42.86 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1619  fibrillarin  41.36 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1009  fibrillarin  40.84 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0295  fibrillarin  40.84 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0761  fibrillarin  41.15 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1392  fibrillarin  39.09 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0694  fibrillarin  44.85 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2087  fibrillarin  44.06 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1469  fibrillarin  39.27 
 
 		 230 aa  141  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1042  fibrillarin  43.24 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1310  fibrillarin  40.31 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.374179 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1107  fibrillarin  40.82 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0401  fibrillarin  39.29 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.939186  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1727  fibrillarin  39.8 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.319108  hitchhiker  0.000219848 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00110  methyltransferase, putative  37.68 
 
 		 314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.011265  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1366  fibrillarin  39.8 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0331367 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32524  predicted protein  39.5 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0377  fibrillarin  38.97 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.939654  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80065  U3 snoRNP protein  37.44 
 
 		 325 aa  123  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48920  predicted protein  40.78 
 
 		 317 aa  121  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00745  hypothetical protein similar to fibrillarin, nucleolar protein (Eurofung)  40 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>