33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48920 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_48920  predicted protein  100 
 
 		 317 aa  624  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32524  predicted protein  73.79 
 
 		 243 aa  374  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80065  U3 snoRNP protein  71.19 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00745  hypothetical protein similar to fibrillarin, nucleolar protein (Eurofung)  70.89 
 
 		 317 aa  349  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00110  methyltransferase, putative  70.34 
 
 		 314 aa  346  3e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.011265  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1916  fibrillarin  46.3 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1723  fibrillarin  47.22 
 
 		 233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1107  fibrillarin  47.03 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1392  fibrillarin  44.44 
 
 		 224 aa  193  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1366  fibrillarin  45.38 
 
 		 235 aa  189  7e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0331367 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0401  fibrillarin  44.58 
 
 		 235 aa  188  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.939186  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0377  fibrillarin  44.49 
 
 		 233 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.939654  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1310  fibrillarin  45.06 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.374179 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1727  fibrillarin  44.81 
 
 		 235 aa  187  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.319108  hitchhiker  0.000219848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0804  fibrillarin  46.55 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1469  fibrillarin  42.59 
 
 		 230 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0295  fibrillarin  40.74 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0761  fibrillarin  42.92 
 
 		 231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1009  fibrillarin  40.28 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1619  fibrillarin  40.57 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1561  fibrillarin  42.92 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0628275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0517  fibrillarin  48.88 
 
 		 199 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0661  fibrillarin  42.11 
 
 		 212 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0465318  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0406  fibrillarin  43.88 
 
 		 208 aa  139  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0816972  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0542  fibrillarin  45.36 
 
 		 200 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2087  fibrillarin  42.03 
 
 		 211 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1042  fibrillarin  40.8 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1636  fibrillarin  41.08 
 
 		 200 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0694  fibrillarin  41.92 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2238  fibrillarin  41.06 
 
 		 213 aa  126  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.665661 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2744  fibrillarin  41.11 
 
 		 207 aa  119  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0150  fibrillarin  34.27 
 
 		 211 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2264  fibrillarin  45.52 
 
 		 205 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0802859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>