16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0651 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0651  methanogenesis marker protein 8  100 
 
 
286 aa  579  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2118  hypothetical protein  53.71 
 
 
288 aa  318  7.999999999999999e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.955884  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0346  hypothetical protein  55.05 
 
 
286 aa  297  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000781127  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1536  hypothetical protein  51.24 
 
 
285 aa  291  9e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0484595  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2764  hypothetical protein  49.82 
 
 
282 aa  288  8e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0318  hypothetical protein  49.11 
 
 
287 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2866  hypothetical protein  46.29 
 
 
282 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.392243  hitchhiker  0.00245143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2863  hypothetical protein  44.01 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00559733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0338  hypothetical protein  42.96 
 
 
282 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0353  hypothetical protein  43.71 
 
 
300 aa  230  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0289554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0949  hypothetical protein  40.89 
 
 
284 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1605  hypothetical protein  43.66 
 
 
280 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.218133  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1764  hypothetical protein  40.36 
 
 
283 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0917  hypothetical protein  40.22 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.367411  normal  0.978822 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1027  hypothetical protein  40.36 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1267  hypothetical protein  36.24 
 
 
286 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>