16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1536 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1536  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  560  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0484595  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2764  hypothetical protein  55.36 
 
 
282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2118  hypothetical protein  52.84 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.955884  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0651  methanogenesis marker protein 8  51.24 
 
 
286 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0346  hypothetical protein  52.98 
 
 
286 aa  289  3e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000781127  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2863  hypothetical protein  46.64 
 
 
283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00559733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0318  hypothetical protein  47.5 
 
 
287 aa  241  7.999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2866  hypothetical protein  43.31 
 
 
282 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.392243  hitchhiker  0.00245143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0338  hypothetical protein  43.11 
 
 
282 aa  221  9e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1764  hypothetical protein  40.89 
 
 
283 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0917  hypothetical protein  39.78 
 
 
283 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.367411  normal  0.978822 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1605  hypothetical protein  43.11 
 
 
280 aa  212  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.218133  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0949  hypothetical protein  38.38 
 
 
284 aa  209  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1027  hypothetical protein  37.59 
 
 
287 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0353  hypothetical protein  37.33 
 
 
300 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0289554  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1267  hypothetical protein  40.21 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>