16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1027 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1027  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1764  hypothetical protein  92.23 
 
 
283 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0917  hypothetical protein  90.81 
 
 
283 aa  521  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.367411  normal  0.978822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0949  hypothetical protein  72.6 
 
 
284 aa  417  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0353  hypothetical protein  57.04 
 
 
300 aa  340  2e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0289554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0338  hypothetical protein  49.1 
 
 
282 aa  270  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2866  hypothetical protein  47.35 
 
 
282 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.392243  hitchhiker  0.00245143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2863  hypothetical protein  44.29 
 
 
283 aa  242  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00559733 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1605  hypothetical protein  43.12 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.218133  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0651  methanogenesis marker protein 8  40.36 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2764  hypothetical protein  40.3 
 
 
282 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0346  hypothetical protein  40.58 
 
 
286 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000781127  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1536  hypothetical protein  37.59 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0484595  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2118  hypothetical protein  35.51 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.955884  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0318  hypothetical protein  36.5 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1267  hypothetical protein  31.41 
 
 
286 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>