16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1764 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1764  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  564  1e-160  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0917  hypothetical protein  93.29 
 
 
283 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.367411  normal  0.978822 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1027  hypothetical protein  92.23 
 
 
287 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0949  hypothetical protein  73.59 
 
 
284 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0353  hypothetical protein  59.11 
 
 
300 aa  352  5e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0289554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0338  hypothetical protein  50.18 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2866  hypothetical protein  47 
 
 
282 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.392243  hitchhiker  0.00245143 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1605  hypothetical protein  44.44 
 
 
280 aa  241  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.218133  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2863  hypothetical protein  43.93 
 
 
283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00559733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0651  methanogenesis marker protein 8  40.36 
 
 
286 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0346  hypothetical protein  42.39 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000781127  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2764  hypothetical protein  39.93 
 
 
282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1536  hypothetical protein  40.89 
 
 
285 aa  210  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0484595  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2118  hypothetical protein  37.5 
 
 
288 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.955884  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0318  hypothetical protein  37.26 
 
 
287 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1267  hypothetical protein  32.13 
 
 
286 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>