30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5104 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5483  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  183  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5192  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  183  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5104  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1097  hypothetical protein  46.51 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276681  normal  0.325571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5720  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  47.76 
 
 
489 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  44 
 
 
508 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  42.5 
 
 
510 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  47.76 
 
 
506 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  40.23 
 
 
552 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  40.7 
 
 
519 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  40.7 
 
 
507 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  40.7 
 
 
519 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  40.7 
 
 
507 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  40.7 
 
 
355 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  40.7 
 
 
507 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  41.11 
 
 
511 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  39.53 
 
 
507 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  39.53 
 
 
507 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  39.53 
 
 
507 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  40 
 
 
508 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  46.27 
 
 
501 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  33.33 
 
 
495 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  36.67 
 
 
499 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  36.67 
 
 
454 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  32.26 
 
 
497 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  34.07 
 
 
493 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  30.77 
 
 
454 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  36.08 
 
 
473 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  36.08 
 
 
473 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>