66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_R0001 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0002  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0012  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0010  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0009  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0049  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0069  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448955  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0007  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0007  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289353  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2975  hypothetical protein  88.89 
 
 		 252 bp  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0062  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0121694  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0061  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0055  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4794  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R23  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.7190299999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5710  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4567  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0545  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3943e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4757  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000781489  hitchhiker  6.01027e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0637  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000118673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000014568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0296207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5794  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5721  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00371423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4618  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000037531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0619  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.152759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000188578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0121  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000324083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0093  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778252  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000146044  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0117  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0089  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5686  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000717996  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>