43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1228 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1228  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  100 
 
 		 373 aa  763    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.782228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0727  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  97.59 
 
 		 373 aa  749    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.181711  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1472  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  97.32 
 
 		 373 aa  748    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0768307  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1242  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  77.36 
 
 		 389 aa  619  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0624  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  58.4 
 
 		 375 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0713  N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  31.28 
 
 		 369 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.625047 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1426  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.59 
 
 		 350 aa  215  9e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1456  N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  33.07 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.791698  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1656  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  35.66 
 
 		 352 aa  213  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.685631  hitchhiker  0.00365754 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2358  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  33.07 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.753048  normal  0.118672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1529  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  31.38 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0969077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3148  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.93 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1987  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  35.28 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1394  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.95 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0683  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  33.8 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.419817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3224  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  31.31 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.365654  normal  0.0592846 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1309  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  34.46 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0659  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  32.11 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.321496  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2545  N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  32.72 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0595  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  32.94 
 
 		 358 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0626  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.87 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345711  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1225  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  31.43 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1919  N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  32.65 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.518204  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0379  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.11 
 
 		 384 aa  175  9e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0479269  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1726  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  33.07 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1845  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.65 
 
 		 374 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.122809  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0297  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.41 
 
 		 340 aa  166  8e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1698  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.11 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.483787  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0794  hypothetical protein  31.71 
 
 		 379 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.778881  hitchhiker  0.000000911512 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23472  predicted protein  24.89 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65944  tRNA (guanine-N2-)-methyltransferase  27.1 
 
 		 520 aa  126  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.624062 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16869  predicted protein  27.99 
 
 		 427 aa  119  7.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0335013  normal  0.0476998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2430  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  23.56 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09406  An-Trm1 protein related to S. cerevisiae Trm1 (Eurofung)  31.28 
 
 		 700 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721786  normal  0.0131192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0835  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  23.62 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.172881 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00760  tRNA (guanine-N2-)-methyltransferase, putative  26.15 
 
 		 666 aa  90.9  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0341167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5066  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  23.03 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980831 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17464  predicted protein  24.7 
 
 		 430 aa  79.3  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08491  N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  24.74 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1987  N(2),N(2)-dimethylguanosine tRNA methyltransferase  22.22 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.903834  normal  0.15835 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0673  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  22.4 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0457007  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  36.17 
 
 		 341 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  32.91 
 
 		 199 aa  43.1  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>