24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1280 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1280  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  274  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0117332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0638  hypothetical protein  93.48 
 
 
138 aa  260  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0377561  normal  0.0366287 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0185  hypothetical protein  93.48 
 
 
138 aa  258  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328182  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0704  hypothetical protein  76.81 
 
 
138 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.213934  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0133  hypothetical protein  64.44 
 
 
136 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0812  hypothetical protein  48.8 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.465154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2615  hypothetical protein  37.4 
 
 
146 aa  114  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0315  Protein of unknown function DUF371  39.1 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.106232  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0042  Protein of unknown function DUF371  50.42 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0527  Protein of unknown function DUF371  34.06 
 
 
151 aa  107  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3076  Protein of unknown function DUF371  38.35 
 
 
138 aa  107  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.862227  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2703  Protein of unknown function DUF371  40.6 
 
 
137 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2593  Protein of unknown function DUF371  37.59 
 
 
137 aa  103  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1282  hypothetical protein  36.69 
 
 
142 aa  102  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.442116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1895  hypothetical protein  35.61 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.259544 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0745  hypothetical protein  36.44 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.120646  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1982  hypothetical protein  35.59 
 
 
141 aa  93.6  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1727  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  89  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.166522  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0781  Protein of unknown function DUF371  34.65 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2061  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2289  hypothetical protein  29.92 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.904061  normal  0.190506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0301  hypothetical protein  32.95 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1931  hypothetical protein  31.01 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0891  Protein of unknown function DUF371  30 
 
 
378 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>