17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0301 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0301  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  245  1e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0042  Protein of unknown function DUF371  37.21 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0185  hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328182  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0638  hypothetical protein  35.23 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0377561  normal  0.0366287 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0704  hypothetical protein  33.72 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.213934  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0133  hypothetical protein  29.29 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1280  hypothetical protein  32.95 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0117332  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1727  hypothetical protein  32.29 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.166522  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2593  Protein of unknown function DUF371  33.71 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0812  hypothetical protein  32.22 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.465154 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3076  Protein of unknown function DUF371  29.21 
 
 
138 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.862227  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2289  hypothetical protein  33.8 
 
 
156 aa  48.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.904061  normal  0.190506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2061  hypothetical protein  52.27 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0315  Protein of unknown function DUF371  29.89 
 
 
137 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.106232  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0745  hypothetical protein  30.21 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.120646  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1282  hypothetical protein  29.9 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.442116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2703  Protein of unknown function DUF371  34.55 
 
 
137 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>