14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1364 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1364  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0641  hypothetical protein  94.33 
 
 
194 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1312  hypothetical protein  90.72 
 
 
194 aa  371  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1321  hypothetical protein  71.35 
 
 
194 aa  300  8.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1057  hypothetical protein  64.58 
 
 
192 aa  258  4e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00992508  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1247  Protein of unknown function DUF207  30.85 
 
 
192 aa  106  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0125  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  94.7  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0720  hypothetical protein  33.09 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000743428 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0351  hypothetical protein  30.32 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0308  hypothetical protein  27.18 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.897433  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1813  hypothetical protein  27.18 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.212235  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0991  hypothetical protein  25.64 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.743271  hitchhiker  0.00205411 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1686  Protein of unknown function DUF207  24 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56695  predicted protein  26.07 
 
 
285 aa  49.3  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.077918  normal  0.102052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>