22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1353 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1353  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  93.37 
 
 
181 aa  344  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1323  hypothetical protein  89.5 
 
 
181 aa  328  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1332  hypothetical protein  57.14 
 
 
187 aa  210  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.424525  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0868  hypothetical protein  49.74 
 
 
190 aa  159  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.170494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0685  protein of unknown function DUF447  25.58 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0768  hypothetical protein  24.44 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1414  hypothetical protein  27.91 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.378071  normal  0.11817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2455  hypothetical protein  26.09 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.11758  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5940  hypothetical protein  22.58 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1607  hypothetical protein  25.58 
 
 
215 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.536381  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2393  protein of unknown function DUF447  23.86 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1107  hypothetical protein  28.65 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  26.37 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1580  hypothetical protein  26.34 
 
 
191 aa  48.9  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000289305  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1792  hypothetical protein  23.53 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0665  hypothetical protein  22.35 
 
 
202 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1727  hypothetical protein  21.91 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3142  hypothetical protein  23.3 
 
 
195 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3074  protein of unknown function DUF447  24.42 
 
 
193 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0214  hypothetical protein  24.71 
 
 
198 aa  44.3  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2726  hypothetical protein  22.09 
 
 
196 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.129354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>