15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0685 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0685  protein of unknown function DUF447  100 
 
 
187 aa  385  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1727  hypothetical protein  55.62 
 
 
191 aa  193  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1414  hypothetical protein  56.11 
 
 
185 aa  192  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.378071  normal  0.11817 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1107  hypothetical protein  46.93 
 
 
188 aa  160  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0665  hypothetical protein  42.46 
 
 
202 aa  147  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1607  hypothetical protein  38.04 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.536381  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0214  hypothetical protein  34.83 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0768  hypothetical protein  41.76 
 
 
193 aa  106  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1353  hypothetical protein  25.58 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2584  protein of unknown function DUF447  33.33 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.735694  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2337  protein of unknown function DUF447  34.33 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0425454  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  23.84 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1890  protein of unknown function DUF447  36.56 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1323  hypothetical protein  23.84 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0765  protein of unknown function DUF447  28.8 
 
 
198 aa  48.5  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>