25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2617 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3074  protein of unknown function DUF447  66.14 
 
 		 193 aa  246  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3142  hypothetical protein  65.43 
 
 		 195 aa  244  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6498  hypothetical protein  58.38 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760399  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2455  hypothetical protein  57.98 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.11758  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5940  hypothetical protein  56.91 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1580  hypothetical protein  54.59 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000289305  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4099  hypothetical protein  50.79 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2726  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1792  hypothetical protein  48.35 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2393  protein of unknown function DUF447  50.26 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1841  hypothetical protein  48.9 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1244  hypothetical protein  51.45 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2176  protein of unknown function DUF447  48.9 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5322  protein of unknown function DUF447  46.96 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5018  hypothetical protein  46.96 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2424  protein of unknown function DUF447  32.83 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0904426  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0214  hypothetical protein  23.91 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1353  hypothetical protein  26.37 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0868  hypothetical protein  27.32 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.170494  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0768  hypothetical protein  28.09 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  25.41 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1323  hypothetical protein  24.86 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1607  hypothetical protein  23.68 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.536381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2584  protein of unknown function DUF447  26.32 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.735694  normal  0.380444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>