23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3074 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3074  protein of unknown function DUF447  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3142  hypothetical protein  65.22 
 
 		 195 aa  247  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  66.14 
 
 		 196 aa  246  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2455  hypothetical protein  62.64 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.11758  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6498  hypothetical protein  61.2 
 
 		 201 aa  227  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760399  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5940  hypothetical protein  61.58 
 
 		 197 aa  221  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4099  hypothetical protein  58.15 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1580  hypothetical protein  56.83 
 
 		 191 aa  207  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000289305  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1244  hypothetical protein  56.6 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2393  protein of unknown function DUF447  52.84 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2726  hypothetical protein  50.79 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1841  hypothetical protein  50.28 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2176  protein of unknown function DUF447  50.56 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1792  hypothetical protein  49.44 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5322  protein of unknown function DUF447  50.28 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5018  hypothetical protein  50.85 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2424  protein of unknown function DUF447  31.5 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0904426  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0768  hypothetical protein  26.44 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  24.56 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0214  hypothetical protein  25.82 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1353  hypothetical protein  24.42 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1332  hypothetical protein  25.44 
 
 		 187 aa  44.7  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.424525  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1323  hypothetical protein  23.86 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>