23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5940 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5940  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2455  hypothetical protein  60.89 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.11758  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6498  hypothetical protein  58.38 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760399  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3074  protein of unknown function DUF447  61.58 
 
 		 193 aa  221  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  56.91 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3142  hypothetical protein  56.18 
 
 		 195 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2393  protein of unknown function DUF447  54.1 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1580  hypothetical protein  54.49 
 
 		 191 aa  191  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000289305  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4099  hypothetical protein  54.79 
 
 		 189 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1244  hypothetical protein  53.33 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2726  hypothetical protein  48.89 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1841  hypothetical protein  46.2 
 
 		 198 aa  164  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2176  protein of unknown function DUF447  46.2 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1792  hypothetical protein  46.2 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5322  protein of unknown function DUF447  44.38 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5018  hypothetical protein  44.38 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2424  protein of unknown function DUF447  29.85 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0904426  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0768  hypothetical protein  29.73 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1353  hypothetical protein  22.58 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0765  protein of unknown function DUF447  30.37 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  22.04 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0214  hypothetical protein  25.13 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1323  hypothetical protein  21.51 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>