15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0317 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0317  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  246  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  hitchhiker  0.0079489 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  30.77 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  33.05 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  29.06 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  24.14 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  24.07 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  23.93 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  27.05 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  27.05 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  30.4 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  30.17 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  26.96 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  43.08 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  28.07 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>