15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1204 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1204  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.800008  normal  0.0975612 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1612  hypothetical protein  45.18 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.114334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1618  hypothetical protein  38.67 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0883  hypothetical protein  41.96 
 
 
340 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  hitchhiker  0.000961296 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0943  hypothetical protein  40.27 
 
 
179 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.583263  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1287  hypothetical protein  40.43 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0945  hypothetical protein  39.16 
 
 
330 aa  97.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0846203  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0523  hypothetical protein  42.02 
 
 
188 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.443141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0569  hypothetical protein  41.13 
 
 
376 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0524  hypothetical protein  35.21 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0428  hypothetical protein  34.55 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.389413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1492  hypothetical protein  32.93 
 
 
179 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.637613  hitchhiker  0.00277729 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0056  hypothetical protein  32.04 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.000388029  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0865  hypothetical protein  23.76 
 
 
158 aa  47  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.806006  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0447  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000131757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>