14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0943 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0943  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.583263  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1287  hypothetical protein  88.83 
 
 
179 aa  304  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0523  hypothetical protein  65.99 
 
 
188 aa  214  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.443141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0569  hypothetical protein  51.79 
 
 
376 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0524  hypothetical protein  50.62 
 
 
363 aa  154  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0883  hypothetical protein  45.21 
 
 
340 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  hitchhiker  0.000961296 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0945  hypothetical protein  44.52 
 
 
330 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0846203  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0428  hypothetical protein  42.29 
 
 
190 aa  111  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.389413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1618  hypothetical protein  34.13 
 
 
189 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1204  hypothetical protein  40.27 
 
 
190 aa  102  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.800008  normal  0.0975612 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1612  hypothetical protein  40.14 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.114334 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0056  hypothetical protein  28.86 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.000388029  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1492  hypothetical protein  29.88 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.637613  hitchhiker  0.00277729 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0447  hypothetical protein  30.77 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000131757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>