14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0569 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0569  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  761    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0524  hypothetical protein  54.79 
 
 
363 aa  361  1e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0943  hypothetical protein  51.79 
 
 
179 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.583263  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1287  hypothetical protein  55.17 
 
 
179 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0883  hypothetical protein  49.7 
 
 
340 aa  156  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  hitchhiker  0.000961296 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0945  hypothetical protein  50.34 
 
 
330 aa  155  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0846203  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0523  hypothetical protein  51.7 
 
 
188 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.443141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0428  hypothetical protein  41.1 
 
 
190 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.389413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1618  hypothetical protein  35.77 
 
 
189 aa  92.8  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1204  hypothetical protein  41.13 
 
 
190 aa  92.4  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.800008  normal  0.0975612 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0056  hypothetical protein  30.77 
 
 
181 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.000388029  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1612  hypothetical protein  37.33 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.114334 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1492  hypothetical protein  31.72 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.637613  hitchhiker  0.00277729 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0447  hypothetical protein  27.97 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000131757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>