15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1287 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1287  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  366  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0943  hypothetical protein  88.83 
 
 
179 aa  330  9e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.583263  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0523  hypothetical protein  63.27 
 
 
188 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.443141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0569  hypothetical protein  50.61 
 
 
376 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0524  hypothetical protein  50.3 
 
 
363 aa  154  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0945  hypothetical protein  45.89 
 
 
330 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0846203  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0883  hypothetical protein  46.58 
 
 
340 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  hitchhiker  0.000961296 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0428  hypothetical protein  42.41 
 
 
190 aa  110  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.389413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1618  hypothetical protein  36.99 
 
 
189 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1204  hypothetical protein  37.35 
 
 
190 aa  101  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.800008  normal  0.0975612 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1612  hypothetical protein  38 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.114334 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0056  hypothetical protein  30.2 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.000388029  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1492  hypothetical protein  30.41 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.637613  hitchhiker  0.00277729 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0447  hypothetical protein  29.37 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000131757  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0865  hypothetical protein  29.57 
 
 
158 aa  40.8  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.806006  normal  0.0329926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>