14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0428 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0428  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.389413  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0056  hypothetical protein  44.75 
 
 
181 aa  158  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.000388029  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1492  hypothetical protein  44.13 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.637613  hitchhiker  0.00277729 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0945  hypothetical protein  43.06 
 
 
330 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0846203  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0883  hypothetical protein  42.36 
 
 
340 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  hitchhiker  0.000961296 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0447  hypothetical protein  33.67 
 
 
206 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000131757  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0943  hypothetical protein  42.29 
 
 
179 aa  111  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.583263  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1287  hypothetical protein  41.38 
 
 
179 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0569  hypothetical protein  41.1 
 
 
376 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0523  hypothetical protein  39.13 
 
 
188 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.443141  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0524  hypothetical protein  33.99 
 
 
363 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1204  hypothetical protein  34.55 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.800008  normal  0.0975612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1618  hypothetical protein  33.72 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1612  hypothetical protein  27.41 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.114334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>