15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0639 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0639  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0042  PRC-barrel domain protein  48.68 
 
 
86 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1920  PRC-barrel domain-containing protein  46.91 
 
 
83 aa  90.1  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2938  PRC-barrel  50 
 
 
83 aa  87  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000574664  normal  0.9415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2101  PRC-barrel domain-containing protein  50.63 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2035  PRC-barrel protein  39.76 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0076  PRC-barrel domain-containing protein  36.99 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2322  hypothetical protein  35.06 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0785465  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2681  PRC-barrel domain protein  28.21 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1076  PRC-barrel domain protein  30.67 
 
 
80 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1314  PRC-barrel domain protein  34.62 
 
 
79 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2061  hypothetical protein  32.1 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0679932  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2986  hypothetical protein  31.58 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0754  PRC-barrel domain protein  32.5 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2714  PRC-barrel domain protein  45.45 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>