15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0042 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0042  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
86 aa  169  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1920  PRC-barrel domain-containing protein  70.73 
 
 
83 aa  127  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2938  PRC-barrel  59.76 
 
 
83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000574664  normal  0.9415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2101  PRC-barrel domain-containing protein  65.06 
 
 
84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0639  hypothetical protein  48.68 
 
 
83 aa  91.3  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2035  PRC-barrel protein  43.37 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2322  hypothetical protein  40.24 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0785465  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0076  PRC-barrel domain-containing protein  44.87 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2681  PRC-barrel domain protein  36.71 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1076  PRC-barrel domain protein  32.88 
 
 
80 aa  60.8  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1314  PRC-barrel domain protein  35.44 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2061  hypothetical protein  39.51 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0679932  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2714  PRC-barrel domain protein  38.27 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0754  PRC-barrel domain protein  38.27 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2986  hypothetical protein  37.66 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>