18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0754 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0754  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2714  PRC-barrel domain protein  86.42 
 
 
81 aa  142  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2061  hypothetical protein  67.9 
 
 
81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0679932  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2681  PRC-barrel domain protein  61.73 
 
 
79 aa  104  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1314  PRC-barrel domain protein  60.49 
 
 
79 aa  101  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2035  PRC-barrel protein  46.91 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2986  hypothetical protein  47.5 
 
 
81 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2322  hypothetical protein  39.51 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0785465  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2101  PRC-barrel domain-containing protein  37.04 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0076  PRC-barrel domain-containing protein  42.5 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2938  PRC-barrel  38.27 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000574664  normal  0.9415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0042  PRC-barrel domain protein  38.27 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1920  PRC-barrel domain-containing protein  37.04 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0639  hypothetical protein  32.5 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2630  hypothetical protein  35.29 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.660441  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1858  hypothetical protein  34.52 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1076  PRC-barrel domain protein  30.56 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0163  PRC-barrel domain-containing protein  30.67 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.156195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>