15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2986 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2986  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  158  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2681  PRC-barrel domain protein  45.45 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1314  PRC-barrel domain protein  43.59 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2714  PRC-barrel domain protein  46.25 
 
 
81 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0754  PRC-barrel domain protein  47.5 
 
 
81 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0076  PRC-barrel domain-containing protein  37.66 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0042  PRC-barrel domain protein  37.66 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2061  hypothetical protein  41.46 
 
 
81 aa  55.1  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0679932  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1920  PRC-barrel domain-containing protein  32.47 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2035  PRC-barrel protein  32.47 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2101  PRC-barrel domain-containing protein  32.47 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2322  hypothetical protein  35.06 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0785465  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2938  PRC-barrel  36.36 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000574664  normal  0.9415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2630  hypothetical protein  45.45 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.660441  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0639  hypothetical protein  31.58 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>