18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1076 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1076  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
80 aa  160  6e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1920  PRC-barrel domain-containing protein  34.67 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0042  PRC-barrel domain protein  32.88 
 
 
86 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2101  PRC-barrel domain-containing protein  28 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2938  PRC-barrel  33.33 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000574664  normal  0.9415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0639  hypothetical protein  30.67 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1739  PRC-barrel domain-containing protein  31.58 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.271345  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0723  PRC-barrel domain-containing protein  30.26 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0603774  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0163  PRC-barrel domain-containing protein  31.58 
 
 
82 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2035  PRC-barrel protein  30.67 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1314  PRC-barrel domain protein  31.17 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0005  PRC-barrel domain-containing protein  31.43 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164752  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0076  PRC-barrel domain-containing protein  29.49 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2322  hypothetical protein  26.67 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0785465  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2681  PRC-barrel domain protein  28.77 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0203  PRC-barrel domain-containing protein  34.29 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.205948  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2061  hypothetical protein  28.95 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0679932  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0754  PRC-barrel domain protein  30.56 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>