16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2938 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2938  PRC-barrel  100 
 
 
83 aa  165  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000574664  normal  0.9415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0042  PRC-barrel domain protein  59.76 
 
 
86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2101  PRC-barrel domain-containing protein  62.65 
 
 
84 aa  110  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1920  PRC-barrel domain-containing protein  51.22 
 
 
83 aa  103  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0639  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  87  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2035  PRC-barrel protein  40.24 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0076  PRC-barrel domain-containing protein  46.15 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2322  hypothetical protein  36.14 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0785465  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2681  PRC-barrel domain protein  34.18 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1314  PRC-barrel domain protein  39.24 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0754  PRC-barrel domain protein  38.27 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2714  PRC-barrel domain protein  37.04 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2061  hypothetical protein  34.57 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0679932  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2986  hypothetical protein  36.36 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1076  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2630  hypothetical protein  41.3 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.660441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>