28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0438 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0438  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
202 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1753  peptidase zinc-dependent  45.83 
 
 
175 aa  176  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0914  Zn-dependent proteases-like  39 
 
 
181 aa  148  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.134032  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1076  peptidase, zinc-dependent  42.41 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.40633  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0829  peptidase, zinc-dependent  49.67 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.435908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2605  peptidase, zinc-dependent  30.81 
 
 
173 aa  94  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0307  peptidase zinc-dependent  33.68 
 
 
173 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3502  peptidase zinc-dependent  32.6 
 
 
173 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1552  peptidase zinc-dependent  32.04 
 
 
184 aa  91.3  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1801  peptidase zinc-dependent  41.35 
 
 
177 aa  88.2  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.357683  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0329  archaemetzincin-like protein  31.22 
 
 
173 aa  86.3  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0334  archaemetzincin-like protein  32.43 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.567826  normal  0.0385783 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1746  peptidase zinc-dependent  33.78 
 
 
180 aa  85.9  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1602  archaemetzincin-like protein  43.56 
 
 
156 aa  85.5  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2061  archaemetzincin-like protein  39.05 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2804  peptidase, zinc-dependent  31.22 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1797  peptidase zinc-dependent  30.59 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0828  archaemetzincin-like protein  41.67 
 
 
152 aa  72  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.687512  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2010  peptidase, zinc-dependent  36.89 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1868  peptidase zinc-dependent  36.89 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1953  peptidase zinc-dependent  36.89 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.885912  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0100  peptidase, zinc-dependent  36.54 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.92951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0006  peptidase zinc-dependent  28.1 
 
 
165 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0006  peptidase zinc-dependent  31.78 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.655175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0006  peptidase zinc-dependent  30.07 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0006  Zn-dependent protease  29.61 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2138  Zn-dependent protease-like protein  26.67 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1302  hypothetical protein  28.85 
 
 
418 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>