32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0006 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0006  peptidase zinc-dependent  100 
 
 
173 aa  334  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.655175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0006  Zn-dependent protease  98.27 
 
 
173 aa  330  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0006  peptidase zinc-dependent  98.84 
 
 
173 aa  330  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0006  peptidase zinc-dependent  70.44 
 
 
165 aa  213  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2010  peptidase, zinc-dependent  37.06 
 
 
180 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1953  peptidase zinc-dependent  37.06 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.885912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1868  peptidase zinc-dependent  37.06 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1797  peptidase zinc-dependent  43.07 
 
 
176 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1801  peptidase zinc-dependent  27.59 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.357683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2605  peptidase, zinc-dependent  30.91 
 
 
173 aa  87  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0329  archaemetzincin-like protein  31.58 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0334  archaemetzincin-like protein  30.77 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.567826  normal  0.0385783 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0307  peptidase zinc-dependent  32.35 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3502  peptidase zinc-dependent  32.35 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1552  peptidase zinc-dependent  32.35 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0828  archaemetzincin-like protein  36.89 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.687512  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1602  archaemetzincin-like protein  38.46 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1753  peptidase zinc-dependent  34.35 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0829  peptidase, zinc-dependent  35.61 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.435908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2804  peptidase, zinc-dependent  32.94 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2061  archaemetzincin-like protein  30.82 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1076  peptidase, zinc-dependent  38.1 
 
 
183 aa  61.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.40633  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1746  peptidase zinc-dependent  26.7 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0914  Zn-dependent proteases-like  31.54 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.134032  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0100  peptidase, zinc-dependent  25 
 
 
186 aa  57.8  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.92951  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0438  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.63 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3039  hypothetical protein  26.97 
 
 
181 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0615593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2945  hypothetical protein  26.97 
 
 
181 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.120804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2858  hypothetical protein  27.53 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00197139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2787  hypothetical protein  28.57 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114614  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2138  Zn-dependent protease-like protein  22.81 
 
 
196 aa  47.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0593  hypothetical protein  27.88 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>