18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2138 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2138  Zn-dependent protease-like protein  100 
 
 
196 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0334  archaemetzincin-like protein  29.14 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.567826  normal  0.0385783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0329  archaemetzincin-like protein  27.53 
 
 
173 aa  62  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0307  peptidase zinc-dependent  24.71 
 
 
173 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1552  peptidase zinc-dependent  24.57 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3502  peptidase zinc-dependent  25.14 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1801  peptidase zinc-dependent  37.65 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.357683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0006  peptidase zinc-dependent  22.81 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1868  peptidase zinc-dependent  24.43 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1953  peptidase zinc-dependent  24.43 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.885912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2605  peptidase, zinc-dependent  24.28 
 
 
173 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2010  peptidase, zinc-dependent  24.43 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0006  Zn-dependent protease  22.22 
 
 
173 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0438  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.67 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2804  peptidase, zinc-dependent  21.43 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1746  peptidase zinc-dependent  37.5 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2061  archaemetzincin-like protein  25.78 
 
 
156 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1797  peptidase zinc-dependent  25.71 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>